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Servicio experimental del sistema crispr / cas12a

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Descripción general
Servicio experimental del sistema crispr / cas12a: crispr / cas12a (anteriormente conocido como cpf1) pertenece al sistema crispr tipo V de la clase 2 y es un mecanismo inmunológico adaptativo entre bacterias y bacterias antiguas para identificar y cortar virus invasores o ADN plasmídico. En comparación con cas9, su modo de trabajo DUT le permite mostrar ventajas significativas en la edición genética, la detección molecular y la regulación multigenética.
Detalles del producto

I,Servicio experimental del sistema crispr / cas12aDefinición del sistema y origen biológico

CRISPR/Cas12a(anteriormente conocido comoCpf1) perteneceClase 2 tipo V sistema crisprEs un mecanismo inmunológico adaptativo entre bacterias y bacterias antiguas utilizado para identificar y cortar virus invasores o ADN plasmídico. En comparación con cas9, su modo de trabajo DUT le permite mostrar ventajas significativas en la edición genética, la detección molecular y la regulación multigenética.


En segundo lugar,Servicio experimental del sistema crispr / cas12aMecanismos moleculares básicos y características técnicas

I) proceso de acción

Ii) comparación de las características clave (cas12a vs cas9)

parámetro CRISPR/Cas12a CRISPR/Cas9
Tamaño de la proteína Aminoácidos 1200 - 1300 (más pequeños) Aminoácidos 1000 - 1600
Dependencia del ARN Solo se necesitacrARN(sin tracrrna) necesitarARNcr + ARNtracrO sgrna quimérica
Procesamiento de crrna Actividad rnase autónoma (capacidad de procesamiento incorporada) Dependencia del huésped rnase III y tracrrna
Tipo de extremo de corte 黏性末端(5' 突出) Extremo plano
Secuencia de reconocimiento PAM 5'-TTTN/TTTV-3'(rico en t) 5'-NGG-3'(rico en g)
Dominio de la nucleasa únicoDominio ruvic Doble dominio Hnh + ruvic
Actividad de corte Trans Sí (puede cortar ssdna no específicamente) Nada

Nota:

  • VIndica a / C / g (no t), como 5 '- ttta / tttc / tttg - 3'.

  • 黏性末端Es más fácil desencadenar la reparación de Recombinación homóloga (hdr) y mejorar la eficiencia de la edición precisa.


III. ventajas y escenarios de aplicación

I) ventajas tecnológicas

  1. Eficiencia de la edición multigenética:

    • Una sola matriz de crrna puede apuntar a múltiples genes al mismo tiempo, sin necesidad de repetir la construcción de tracrna, que es adecuada para la regulación de vías complejas.

  2. Adaptación genómica enriquecida con at:

    • La eficiencia de Edición de genomas ricos en at (como plantas, parásitos) es significativamente mayor que la de cas9.

  3. Bajo riesgo de pérdida de objetivos:

    • Depende estrictamente de la activación de Pam y la actividad de corte Trans se puede cerrar, y la tasa de objetivo de todo el genoma es menor que la de cas9.

  4. Facilidad de entrega:

    • La proteína es más pequeña y es más fácil de empaquetar en vectores virales como aav, lo que es adecuado para la terapia génica in vivo.

(2) áreas de aplicación básicas

Dirección de la aplicación Casos Manifestación de las ventajas
Nocaut multigenético Edición simultánea de tres genes resistentes a la sequía en maíz, con una eficiencia de edición superior al 60% Diseño simplificado de la matriz crrna
Inserción genética precisa Mejora de la HDR con terminales pegajosas para lograr la reparación dirigida del gen yinzi de coagulación Fix de origen humano Restauración de alta fidelidad
Diagnóstico molecular Desarrollo de la detección de ácidos nucleicos en combinación con la actividad de corte Trans (crispr - detec) Alta sensibilidad sin amplificación PCR
Investigación Antiviral La edición del gen receptor del virus BmNPV en el gusano de seda aumenta la eficiencia antiviral en un 40% en comparación con cas9. Corte eficiente de la zona de enriquecimiento at
Optimización del vector de terapia génica La tasa de pérdida de objetivo de cas12b (variante más pequeña) es un 50% menor que la de cas9, adecuada para la clínica Entrega de alta seguridad